Questions émergentes en technologie génétique

Groupe d’évaluation des applications génomiques dans la pratique et la prévention

À notre époque de médecine personnalisée, il importe d’examiner rigoureusement les bienfaits et les effets néfastes potentiels des tests génétiques avant de les utiliser dans la pratique clinique. Le Groupe d’évaluation des applications génomiques dans la pratique et la prévention (EGAPP) offre un mécanisme fondé sur des données probantes destiné à faciliter l’évaluation des tests génétiques au moment de leur passage de la recherche à la pratique clinique et aux interventions de santé publique.

Formé en 2005, le groupe EGAPP, qui propose une démarche d’évaluation objective, transparente et systématique, fondée sur des données probantes, a pour mandat d’examiner la validité et l’utilité des tests génétiques avant de formuler des recommandations à leur sujet. Le groupe a optimisé les méthodes de collecte, d’analyse et de classification des données probantes sur la validité analytique et clinique et l’utilité clinique de tests génétiques et de tests génomiques, et en a conçu de nouvelles.

The evaluation of genomic applications in practice and prevention (EGAPP) initiative: methods of the EGAPP Working Group. Genetics Med 2009:11(1): http://journals.lww.com/geneticsinmedicine/Abstract/2009/01000/The_Evaluation_of_Genomic_Applications_in_Practice.2.aspx

For more information on the EGAPP working group itself: http://www.egappreviews.org/default.htm

Nouvelle analyse génétique en prévision du traitement du cancer du sein

Le cancer du sein est le cancer féminin le plus fréquent au Canada. La Fondation canadienne du cancer du sein estime que ce cancer frappera 22 700 femmes en 2009, soit une femme sur neuf.

La caractérisation de l’expression génétique dans le but de déterminer la nécessité d’adjoindre la chimiothérapie à l’hormonothérapie dans le cancer du sein au stade précoce sans atteinte des ganglions est d’apparition récente. Il est vrai que la chimiothérapie peut réduire d’environ 25 % le risque de récurrence du cancer du sein, mais elle entraîne des effets indésirables graves et elle est très coûteuse.

L’analyse génétique a pour objectif de déterminer la probabilité de la récurrence et les avantages de la chimiothérapie. Quand la probabilité de récurrence est faible, la chimiothérapie peut être écartée. Les résultats de cette analyse couplés à d’autres renseignements cliniques et tests de laboratoire éclaireront davantage la prise de décisions du clinicien et de la patiente quant au traitement du cancer.

Impact of gene expression profiling tests on breast cancer outcomes. AHRQ, 2008: http://www.ahrq.gov/Clinic/tp/brcgenetp.htm.

Recommendations from the EGAPP Working Group: can tumor gene expression profiling improve outcomes in patients with breast cancer? Genetics Med 2009:11(1):

http://www.egappreviews.org/docs/EGAPPWG-BrCaGEPRec.pdf.

Test génétique en vue de déterminer le risque de cécité

La dégénérescence maculaire liée à l’âge (DMLA) est la principale cause de déficience visuelle au Canada. Non traitée, cette maladie rétinienne progressive peut entraîner la cécité. Le dépistage et le traitement précoces peuvent en freiner énormément la progression.

Un nouveau test génétique permet de déterminer le risque de dégénérescence maculaire. La maladie aurait un fort caractère héréditaire. Grâce au test, le clinicien pourra diagnostiquer la DMLA avant l’apparition des symptômes.

La DMLA étant une maladie toujours incurable, la prévention est primordiale. L’Institut national canadien pour les aveugles préconise des modifications du style de vie, plus précisément des aspects modifiables tels le tabagisme, l’hypertension et la surexposition solaire, pour diminuer le risque de DMLA.

Genetic testing for macular degeneration. AMD Support Canada, 2008: http://www.amdsupport.ca/2008/07/23/genetic-testing-for-macular-degeneration/.

Genetic testing for macular degeneration. AMD Support Canada, 2008 : http://www.amdsupport.ca/2008/07/23/genetic-testing-for-macular-degeneration/.

Test génétique prédictif en vue de déterminer les modalités thérapeutiques dans le cancer du côlon

Un nouveau test génétique, qui relève les mutations de 12 gènes exprimés dans le cancer du côlon, s’adresse aux personnes atteintes de ce cancer au stade II. Le test est conçu pour prévoir les cas à risque élevé et les cas à risque faible de récurrence du cancer par suite du traitement chirurgical. Le cancer du côlon de stade II disparaît après la chirurgie dans près de 80 % des cas. Toutefois, il n’y a pas de moyen fiable de savoir qui devra subir une chimiothérapie.

Dans le groupe des malades à risque faible, la probabilité de récurrence du cancer trois ans après la chirurgie est évaluée à près de 8 %. Quant au groupe à risque élevé, cette probabilité est de 21 %. De toute évidence, le groupe EGAPP estime que « nous n’en savons pas assez pour préconiser le génotypage UGT1A1 courant dans les cas de cancer colorectal métastatique qui seront soumis au traitement par l’irinotécan. »

Recommendations from the EGAPP Working Group: can UGT1A1 genotyping reduce morbidity and mortality in patients with metastatic colorectal cancer treated with irinotecan? Genetics Med 2009.

Test génétique de prédisposition au diabète de type 2

La détection d’un gène variant présent chez les personnes atteintes du diabète de type 2 dans une proportion deux fois plus grande que dans la population en général a stimulé le développement d’un test génétique de prédisposition au diabète de type 2.

Le test repère deux allèles d’un facteur de transcription, le Transcription Factor 7-like 2 ou TCF7L2. Le test serait utile en prévention en identifiant les personnes prédisposées avant l’apparition des symptômes; celles-ci pourraient adopter des mesures de réduction du risque de diabète de type 2, notamment perdre du poids ou amorcer un traitement médicamenteux.

À l’heure actuelle, la capacité du test de prévoir la vulnérabilité génétique à l’égard du diabète de type 2 n’est pas plus grande que celle des autres indicateurs de risque.

Genotype score in addition to common risk factors for prediction of type 2 diabetes.  NEJM, 2008: http://content.nejm.org/cgi/content/short/359/21/2208.

Test génétique de dépistage de la trisomie 21

Les progrès accomplis dans le dépistage prénatal tendent à accroître la facilité technique et la sécurité du diagnostic de certaines anomalies fœtales et à permettre l’administration du test tôt dans la grossesse.

Un nouveau test génétique moins effractif pourrait remplacer l’amniocentèse, qui nécessite l’insertion d’une aiguille dans l’utérus et qui augmente le risque d’avortement spontané, pourrait prendre le pas sur celle-ci. Le test analyse le sang de la mère qui renferme son ADN et celui du fœtus. Il détecte des problèmes génétiques plus tôt dans la grossesse, soit à la 12e semaine, que les tests courants.

Le nouveau test recherche les anomalies dans le nombre de chromosomes du fœtus, car ces anomalies sont susceptibles d’entraîner de graves problèmes de développement physique et mental. Outre la trisomie 21, le test détecte d’autres troubles chromosomiques, dont le syndrome d’Edwards et le syndrome de Patau.

Les données probantes sur cette technique proviennent d’une étude de petite envergure menée auprès de 18 femmes enceintes. Une étude de suivi évaluant le test dans un plus grand groupe de femmes est en cours.

A safer test for Down Syndrome: A noninvasive technique screens maternal blood for fetal DNA. Technology Review, 2008: http://www.technologyreview.com/biomedicine/21474/.

Indicateurs prévisionnels génétiques de la réussite de la fécondation in vitro

Une analyse sanguine susceptible de faciliter la prise de décisions sur la fécondation in vitro est en cours de mise au point.

La recherche sur l’expression génétique a cerné des biomarqueurs présents dans le sang, qui permettraient de déterminer la probabilité de réussite de l’implantation de l’embryon. L’analyse génétique recense 128 gènes exprimés au début de la grossesse dans une proportion plus élevée d’un facteur deux que chez la femme non enceinte.

La recherche contribuera également à relever les biomarqueurs de certaines manifestations de l’implantation, de l’évolution de la grossesse et de l’issue favorable ou défavorable de la grossesse.

Grâce à cette analyse sanguine, des couples pourront éviter de subir de multiples échecs de fécondation in vitro et épargner des sommes considérables.

Will IVF work for a particular patient? The answer may be found in her blood. Eurekalert, 2009: http://www.eurekalert.org/pub_releases/2009-07/esfh-wiw063009.php.

Lectures suggérées

How will pharmacogenetics impact on pharmacy practice? Pharmacists’ views and educational priorities. NHS Evidence, 2008: http://www.geneticseducation.nhs.uk/downloads/Pharmacogenetics.pdf.

Pharmacoeconomic evaluations of pharmacogenetic and genomic screening programmes: a systematic review on content and adherence to guidelines. Pharmacoeconomics. 2008; 26(7):569-87.

The evaluation of clinical validity and clinical utility of genetic tests.  NHS Evidence, 2007: http://www.phgu.org.uk/file_gateway?link_ID=3932.

Genetic tests for cancer. AHRQ, 2006: http://www.ahrq.gov/clinic/ta/gentests/gentests.pdf.